Cell, à qui Sangohan a confié qu'il peut s'énerver pour devenir très puissant, pond des Petits Cell qui attaquent Sangoku et ses amis. En les voyant se faire attaquer, Sangohan déploie une force extraordinaire et élimine les Petits Cell puis s'attaque à leur progéniture. Durant le combat, Sangohan réussit à délivrer C18, ce qui énerve Cell mais lui fait perde de sa puissance. Cependant, Sangohan tarde trop à l'abattre et Cell joue sa dernière carte en décidant de faire exploser la Terre. Sangoku parvient à se téléporter en sa compagnie sur la planète de Kaioh qui explose aussitôt. Sangoku et Kaio meurent mais Cell réussit à se reconstituer. Il revient subitement et profite de l'effet de surprise pour tuer Trunks. Sangohan, allié à Vegeta, Piccolo et les autres, réussit heureusement à éliminer définitivement le monstre. Ressuscité par le dragon Shenron, Trunks retourne dans son futur et détruire ceux qui menacent son monde tandis que C18 devient la femme de krilin. Quant à Songoku, il refuse de revenir sur Terre pour éviter que d'autres guerriers ne soient tenter de venir le défier. Quant à Satan, il s'empresse de prévenir la presse de sa bravoure au combat. C'est ainsi que la série contre Cell se termine.
Sangoku arrive, en compagnie de Kaioh, au royaume des morts où Sangoku se fait un ami en la personne de Paikuhan (ou Paul Kuhan). Ensemble ils vont aux Enfers afin de mater une révolte orchestrée par Cell, Freezer et son père, le général Zorg. Les méchants sont vaincus en trois temps trois mouvements, victimes de la puissance de Paul Kuhan. Son Goku apprend par la même occasion qu'il existe quatre autres Kaio dans l'au-delà. Son ami Kaio est le Kaio du nord tandis que les trois autres règnent sur les autres royaumes cardinaux. Paul Kuhan est le champion du Kaio de l'Est. Tous obéissent au Grand Kaio, le cinquième Kaio qui organise un super tournoi où s'affrontent les âmes des meilleurs guerriers que l'univers a connu. La finale oppose Paikuhan à Son Goku qui en sort victorieux mais un point de règlement tintilleux l'empêche de recevoir sa récompense. La série fait un saut de sept ans après la mort de Cell. Nous retrouvons un Son Gohan qui fréquente l'université mais qui habite toujours chez sa mère Chichi, à la campagne. Il a un petit frère Son Goten qui ressemble trait pour trait à son père dans les épisodes de Dragon Ball. Goten n'a jamais connu Goku comme celui-ci est décédé avant sa naissance. Il effectue les quatre cents coups avec son aîné Trunks qui rêve de devenir aussi fort que Son Goku ou que son père Vegeta. Les deux garnements sont doués et parviennent à se métamorphoser en Supersayajin. A l'université, Gohan fait la connaissance de Videl, la fille de Satan qui s'est adjugé la victoire sur Cell.
La ville porte son nom! Contrairement à son père, Videl a un potentiel de combat et s'en sert pour maintenir l'ordre ou aider les gens. Gohan demande à Bulma de lui confectionner un costume pour dissimuler son identité afin qu'il puisse jouer au super héros, sans être inquiété par la célébrité par la suite. Videl parvient quand même à le démasquer mais jure de garder le secret s'il lui enseigne ses techniques de combat, notamment comment voler. Son Gohan n'a pas le choix et accepte. Il en profite aussi pour s'entraîner avec Goten dont la force est impressionnante. Deux tournois ont lieu. C'est en réalité la même compétition, le fameux Tenkaichi Budokai mais avec une version pour les juniors (moins de quinze ans) et les seniors. Le tournoi junior est une formalité pour Trunks et Goten qui se retrouvent en final et doivent se transformer en super sayen pour se départager. Trunks est vainqueur et a le privilège d'affronter Satan qui va au tapis dès le premier coup. Bien entendu, tout le monde croit que Satan a fait exprès de perdre et l'acclame. Trunks est déçu par ces combats sans intérêt et décide avec Goten de participer au tournoi senior. Ils prennent la place d'un concurrent et montent l'un sur l'autre puis enfilent un costume pour ne pas être reconnus. Contrairement aux années précédentes, les plus grands guerriers participent au tournoi senior. Piccolo, krilin, Videl, Gohan, et Vegeta sont présents. Même Goku est là. Il a obtenu une permission exceptionnelle d'un jour pour assister aux combats sur la Terre. Leurs adversaires sont aussi à la hauteur. Deux d'entre eux sont Shin et son serviteur Kibito. Shin n'est rien de moins qu'un dieu plus important que les Kaios. Le tournoi est hélas interrompu. Deux des concurrents, Yamu et Sporovitch interviennent dans le duel qui oppose Son Gohan à Kibito, au moment où Gohan se transforme en Super Sayajin. Les deux hommes marqués par le signe M sur le front, s'emparent de l'énergie dégagée par Son Gohan et s'enfuient. Epuisé, Son Gohan tombe à terre tandis que Shin se lancent à la poursuite des deux voleurs avec Vegeta, Son Goku et Piccolo. Yamu et Sporovitch rejoignent le vaisseau du sorcier Babidi qui s'est adjoint Dabla, le prince des ténèbres.
Ils confient l'énergie de Gohan au sorcier qui compte la transmettre à sa créature démon à l'état hybride qui a grand besoin de force pour arriver à maturité. N'ayant plus besoin de ses deux sbires, Babidi ordonne à Dabla de s'en débarrasser. Ce qu'il fait rapidement. Son Gohan ayant retrouvé ses esprits, se lance aussi dans la chasse et rejoint ses amis avec Kibito. Babidi se réfugie dans son vaisseau tandis que Dabla attaque krilin, Kibito et Piccolo. Avant d'effectuer une retraite stratégique, il parvient à les transformer tous les trois en pierre grâce à son pouvoir. Shin exhortent Gohan, Vegeta et Goku à abattre Babidi avant que le monstre ne soit opérationnel. Après quelques rapides combats contre divers monstres dans le vaisseau, Babidi abat sa carte maîtresse. Il parvient à envoûter Vegeta qui devient un démon à ses ordres. Vegeta qui a toujours rêvé d'être le Sayajin le plus puissant n'obéit cependant pas à Babidi et concentre ses attaques sur Son Goku. Le duel est d'une violence inouïe et dégage des amas d'énergie qui sont récupéré par le monstre en gestation au grand désespoir de Shin. Shin et Gohan sont freinés par Dabla qui leur bloque l'accès à la créature. Le monstre surgit enfin. Son apparence est plutôt amusante et il s'est affabulé d'un nom ridicule : Boo. Devant un tel spectacle, Dabla ne peut se retenir de rire et se moque du monstre. Bien mal lui en prend parce qu'il est aussitôt changé en chocolat puis croqué par Boo. Cela permet de lever le sort qui touchait les combattants transformés en pierre. Sous les ordres de Babidi, Boo met hors état de nuire Son Goku, Son Gohan et Shin. Vegeta, toujours envoûté mais étrangement indépendant de l'esprit de Babidi affronte Boo et se sacrifie pour détruire son adversaire dans une méga explosion. Son sacrifice est hélas vain et Boo renaît. Boo voyage alors de ville en ville en massacrant toutes les populations. Comprenez par là qu'il les transforme en divers bonbons ou chocolats qu'il avale. Gohan est soigné par Shin et Kibito qui l'emmènent dans leur monde. Là il apprend à développer sa puissance. Au même moment, Goku qui ignore où se trouve son aîné rabat ses espoirs sur Trunks et Goten.
Il a appris qu'une technique formidable existe. Il s'agit de la fusion et il charge Piccolo d'en enseigner les rudiments aux deux garnements afin qu'ils créent le super sayen le plus puissant qu'il puisse exister. Ils viennent s'entraîner chez Dende, dans le palais céleste. Afin d'occuper Boo en attendant que Goten et Trunk soient opérationnels, Son Goku affronte le monstre et parvient à se transformer en Hyper Sayajin mais ne peut tenir à cause des grandes dépenses d'énergie. Goku parvient au moins à tempérer les ardeurs dévastatrices de Boo en lui promettant l'arrivée d'un guerrier à sa hauteur. Babidi est énervé par l'attitude de Boo qui refuse de suivre ses instructions et commence à l'insulter. Boo l'élimine sans état d'âme avant que Son Goku ne se retire. Boo s'installe dans une contrée déserte et mène une vie tranquille avant le grand jour de son affrontement avec Gotrunks, le guerrier issue de la fusion entre Trunks et Goten. Satan est envoyé par ses fans pour combattre Boo. Arrivé sur place, Satan se dérobe complètement mais parvient à survivre en jouant au fidèle valet zélée. Il met en valeur le bon coté de Boo qui se montre finalement très sociable. Un incident extérieur provoque malheureusement la colère noire de Boo qui se scinde en deux personnalités Boo , un être sociable et Super Boo, un être profondément cruel et malfaisant. Les deux entités s'affrontent en un rapide combat d'où Super Boo ressort vainqueur. Il avale Boo mais épargne Satan. Il se dirige directement au palais céleste pour affronter Goten et Trunks. Devenus Gotrunks, les deux enfants parviennent à affronter Super Boo dans la salle d'entraînement spéciale et à bien résister. Piccolo condamne l'accès inter dimensionnel afin d'y emprisonner Super Boo même si cela se fait aussi à ses propres dépends. Super Boo réussit pourtant à dépasser la porte alors que les trois autres restent bloquer à l'intérieur de la salle. Super Boo fait alors disparaître tous les autres amis qui attendaient dehors. Quand Goten et Trunk sortent enfin de la salle, il est trop tard et ne peuvent plus fusionner comme ils ont dépasser le temps limite de fusion. Ils sont sauvés par l'intervention Son Gohan qui revient du royaume de Shin. Super Boo n'est pas à la hauteur mais il prend Trunks et Goten par surprise et les absorbe ainsi que Picollo. Il hérite de leurs techniques et de leurs forces. Gohan est absorbé à son tour. Dans l'autre monde, c'est la panique. La quasi-totalité de la population de la Terre a été victime de la folie destructrice de Super Boo. Vegeta est autorisé à revenir sur Terre pour vaincre le monstre. Son Goku a un moyen pour fusionner rapidement avec n'importe qui. Il n'a pas eu le temps d'appliquer la technique avec Gohan donc il ne reste plus que Vegeta. Après quelques déboires, il parvient enfin à convaincre Vegeta d'accepter la fusion et les deux super Sayajin donnent naissance à un super guerrier. Le combat final ne s'effectue pas jusqu'au bout parce que Vegeta et Goku se laissent absorbés, mettent fin à la fusion puis investissent le corps de Super Boo et arrivent à libérer leurs amis prisonniers. Superboo est finalement vaincus et l'intégralité des victimes est ressuscitée.